Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K4Q9Y6R4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms