Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms