Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLXND1Q9Y4D7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms