Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
DCAF1Q9Y4B6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
DCAF1Q9Y4B6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms