Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
RAD54L2Q9Y4B4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RAD54L2Q9Y4B4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RAD54L2Q9Y4B4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms