Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNFSF13BQ9Y275 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFSF13BQ9Y275 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms