Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUDCQ9Y266 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms