Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC3Q9UQE7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms