Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN6Q9UQ52 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN6Q9UQ52 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms