Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HPS5Q9UPZ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HPS5Q9UPZ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPS5Q9UPZ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms