Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPCN1Q9ULQ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPCN1Q9ULQ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
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