Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN2Q9ULH4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN2Q9ULH4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms