Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DENND2AQ9ULE3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DENND2AQ9ULE3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms