Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC9Q9UKV0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC9Q9UKV0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC9Q9UKV0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms