Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PACSIN3Q9UKS6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms