Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARP4Q9UKK3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARP4Q9UKK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARP4Q9UKK3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms