Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHIC2Q9UKJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHIC2Q9UKJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms