Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCNL1Q9UK58 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCNL1Q9UK58 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms