Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC23Q9UJX2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms