Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSKSQ9UJT2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSKSQ9UJT2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms