Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT7Q9UIV1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT7Q9UIV1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms