Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPA4Q9UI42 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms