Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMGXB4Q9UGU5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms