Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APEX2Q9UBZ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms