Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XCL2Q9UBD3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms