Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDH10Q9P2E7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH10Q9P2E7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH10Q9P2E7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH10Q9P2E7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH10Q9P2E7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms