Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHPF2Q9P2E5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHPF2Q9P2E5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms