Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN3Q9P232 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms