Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM5Q9P217 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM5Q9P217 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms