Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
CCDC180Q9P1Z9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms