Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms