Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms