Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXXC1Q9P0U4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms