Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD4Q9NZQ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD4Q9NZQ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms