Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDND1Q9NY35 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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