Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM9Q9NXL9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCM9Q9NXL9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms