Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXD4L1Q9NU39 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXD4L1Q9NU39 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms