Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PDS5BQ9NTI5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PDS5BQ9NTI5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PDS5BQ9NTI5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1166.4 ms