Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN4Q9NRL3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN4Q9NRL3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms