Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG9

AAAS, Aladin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAASQ9NRG9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AAASQ9NRG9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AAASQ9NRG9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms