Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHST12Q9NRB3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST12Q9NRB3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms