Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PRDM8Q9NQV8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PRDM8Q9NQV8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms