Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYLDQ9NQC7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYLDQ9NQC7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms