Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FZD3Q9NPG1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FZD3Q9NPG1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms