Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPCPD1Q9NPB8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPCPD1Q9NPB8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms