Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CABP2Q9NPB3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms