Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPJQ9HC77 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms