Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EBF2Q9HAK2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EBF2Q9HAK2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms