Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF41Q9H4P4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF41Q9H4P4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms