Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00597Q9H2U6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms